Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RABEP1Q15276 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABEP1Q15276 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms