Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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