Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms