Protein–RNA interactions for Protein: Q13952

NFYC, Nuclear transcription factor Y subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYCQ13952 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFYCQ13952 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFYCQ13952 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFYCQ13952 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFYCQ13952 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFYCQ13952 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFYCQ13952 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFYCQ13952 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFYCQ13952 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFYCQ13952 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFYCQ13952 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFYCQ13952 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NFYCQ13952 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms