Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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CUL4AQ13619 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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