Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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