Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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