Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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