Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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TRAF1Q13077 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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