Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms