Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms