Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms