Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms