Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SUMO1P63165 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms