Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms