Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BGRP55822 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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