Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NESP48681 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NESP48681 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NESP48681 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NESP48681 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NESP48681 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NESP48681 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NESP48681 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NESP48681 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NESP48681 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NESP48681 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NESP48681 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NESP48681 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NESP48681 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NESP48681 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NESP48681 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NESP48681 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NESP48681 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NESP48681 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NESP48681 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NESP48681 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NESP48681 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NESP48681 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NESP48681 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NESP48681 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NESP48681 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NESP48681 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NESP48681 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NESP48681 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NESP48681 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NESP48681 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NESP48681 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NESP48681 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NESP48681 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NESP48681 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NESP48681 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NESP48681 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NESP48681 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NESP48681 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NESP48681 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NESP48681 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NESP48681 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NESP48681 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NESP48681 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NESP48681 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NESP48681 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NESP48681 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NESP48681 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NESP48681 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NESP48681 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NESP48681 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NESP48681 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NESP48681 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NESP48681 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NESP48681 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NESP48681 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NESP48681 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms