Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms