Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCLMP48507 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCLMP48507 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms