Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ME1P48163 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ME1P48163 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ME1P48163 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ME1P48163 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ME1P48163 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ME1P48163 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ME1P48163 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ME1P48163 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ME1P48163 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ME1P48163 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms