Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GJC1P36383 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GJC1P36383 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GJC1P36383 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GJC1P36383 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GJC1P36383 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GJC1P36383 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GJC1P36383 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GJC1P36383 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GJC1P36383 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GJC1P36383 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJC1P36383 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJC1P36383 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJC1P36383 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
GJC1P36383 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJC1P36383 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJC1P36383 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJC1P36383 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms