Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms