Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms