Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRPH2P23942 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms