Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNT1P13805 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms