Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL3P10147 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL3P10147 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms