Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI3P10071 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GLI3P10071 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI3P10071 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI3P10071 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI3P10071 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GLI3P10071 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GLI3P10071 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GLI3P10071 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GLI3P10071 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GLI3P10071 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GLI3P10071 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms