Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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GMDSO60547 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GMDSO60547 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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GMDSO60547 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GMDSO60547 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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