Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP104O60308 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP104O60308 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP104O60308 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms