Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DENRO43583 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DENRO43583 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DENRO43583 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DENRO43583 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DENRO43583 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DENRO43583 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DENRO43583 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DENRO43583 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DENRO43583 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DENRO43583 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DENRO43583 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms