Protein–RNA interactions for Protein: O43323

DHH, Desert hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHHO43323 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DHHO43323 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DHHO43323 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DHHO43323 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms