Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCER2I3L3R5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms