Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms