Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms