Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms