Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms