Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms