Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms