Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf109Q9NX04 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms