Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG7

SIRT3, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT3Q9NTG7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIRT3Q9NTG7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms