Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLMQ9NP87 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms