Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms