Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF1Q9H7N4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms