Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM4

GGACT, Gamma-glutamylaminecyclotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGACTQ9BVM4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GGACTQ9BVM4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms