Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPNS2Q96L46 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms