Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms