Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
STAMBPL1Q96FJ0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms