Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPS1Q96D71 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPS1Q96D71 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms