Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms