Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEO1Q92859 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms